Le ministre de l'Intérieur, Manuel Valls a été interrogé sur la place du Conseil français du culte musulman  comme "instance représentative de l'islam de France".
Il a souhaité la "fin des instrumentalisations" et un travail "strictement lié à l'organisation du culte":

Je ne veux pas que soient confondues les questions d'immigration, d'intégration et les questions liées au culte.
En matière de culte, l'Etat a besoin de dialoguer avec des institutions représentatives et pérennes. Je veux, par rapport à la période précédente, mettre fin aux instrumentalisations et aux polémiques politiciennes.
C'est pourquoi je souhaite que le travail entre l'Etat et le CFCM se focalise strictement sur les questions liées à l'organisation du culte.
Il est de la responsabilité du CFCM d'apaiser les divisions et de s'organiser.

Manuel Valls a donc demandé au CFCM de mettre fin à ses luttes internes: le 11 juillet, la Mosquée de Paris, qui constitue l'une des trois grandes fédérations de l'islam de France, a en effet démissionné du CFCM invoquant "de graves dysfonctionnements" et une "gouvernance autocratique"